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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
香港中联办主任郑雁雄拜会特首李家超******
中新社香港1月17日电 中央人民政府驻香港特别行政区联络办公室(香港中联办)主任郑雁雄17日上午到礼宾府拜会香港特区行政长官李家超，向他致以新春祝福。李家超再次对郑雁雄出任香港中联办主任和香港特区国安委国家安全事务顾问表示欢迎，双方就当前香港社会形势和如何推进香港由治及兴进行了交流。
1月17日，中央人民政府驻香港特别行政区联络办公室主任郑雁雄（左）到礼宾府拜会香港特区行政长官李家超，向他致以新春祝福。 中新社记者 李志华 摄据香港中联办发布的消息，郑雁雄谈到，自己担任驻港国安公署署长期间，和李家超行政长官合作密切。担任中联办主任之后，将带领全体同仁一如既往，进一步加强与行政长官和特区政府的常态化沟通，广泛听取香港社会各界的意见，充分尊重、全力支持行政长官和特区政府依法施政。
交流中双方一致认为，香港正处在从由乱到治走向由治及兴的新阶段，要全面准确、坚定不移贯彻“一国两制”方针，维护宪法和基本法确定的特别行政区宪制秩序，坚持中央全面管治权和保障特别行政区高度自治权相统一，落实“爱国者治港”原则。要发挥香港优势和特点，大力发展经济、改善民生，不断增强发展动能，促进香港长期繁荣稳定。要主动对接“十四五”规划、粤港澳大湾区建设和“一带一路”高质量发展等国家战略，更好融入国家发展大局。双方坚信，有中央对香港的关心关怀，有强大祖国作坚强后盾，有香港社会各界的共同努力，香港一定能巩固当前“治”的局面，增强“兴”的动能，进一步开创由治及兴新局面，在中华民族伟大复兴的历史进程中作出新的更大贡献。
香港特区行政长官办公室同日发布消息称，李家超在会面中表示，很有信心与郑雁雄主任共同全面准确贯彻落实“一国两制”、“港人治港”、高度自治方针，维护宪法和香港基本法确定的特区宪制秩序，落实“爱国者治港”原则，积极融入国家发展大局，巩固国际一流大都会地位。
李家超指出，郑雁雄主任熟悉广东省的情况，在协助香港更好融入国家发展大局及参与大湾区建设方面必定事半功倍，踏上更高台阶。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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